La trayectoria de Aina Ayuso empezó en el Sant Just y continuó posteriormente en el Sarrià y en el Almeda.

A nivel de clubs, Aina Ayuso fue tercera de Cataluña y cuarta de España Infantil en la temporada 2012/13 y tras destacar en sus clubs fue becada por el Siglo XXI en la temporada 2013/14.

En agosto de 2014, Aina Ayuso jugó y ganó el Torneo de la Amistad con la Selección Española U15.

Llegada la temporada 2014/15 y como cadete de segundo año, Aina Ayuso debutó con Siglo XXI en Liga Femenina 2 y promedió 3.1 puntos, 1.4 rebotes y 0.7 asistencias en 11 minutos por partido. Aina disputó además el Campeonato de España de Selecciones y finalizó en tercera posicíon con Cataluña.

En el verano de 2015, Aina Ayuso jugó con la Selección Española el Campeonato de Europa U16 de 2015 y llegó hasta las Semifinales, promediando 9.7 puntos, 3.2 rebotes, 1.7 asistencias y 1.7 robos por partido.

Aina explotó en Liga Femenina 2 durante la temporada 2015/16 y promedió 11.8 puntos, 4.8 rebotes, 2 asistencias, 3.9 faltas recibidas y +9.4 valoración por partido.

En el verano de 2016, Aina Ayuso disputó el Mundial U17 y promedió 9.7 puntos, 3.6 rebotes y 4.1 asistencias en 25 minutos por partido, siendo la quinta mejor pasadora del Campeonato.

Finalmente, en la temporada 2016/17 y como junior de segundo año, Aina Ayuso promedió 13 puntos, 4.9 rebotes, 3.2 asistencias, 5.6 faltas recibidas y +13 valoración por partido.

Aina hizo doblete en el verano de 2017 y promedió 6.7 puntos, 2.1 rebotes y 2 asistencias en 19 minutos por partido en el Campeonato de Europa U18 y 3.7 puntos, 1.9 rebotes y 2 asistencias en 15 minutos por partido en el Mundial U19.

En la temporada 2017/18, Aina Ayuso se incorporó a la Universidad de Oregon y ganó el Campeonato de la Pac 12 y llegó hasta el NCAA Elite 8.

En el verano de 2018, Aina Ayuso ganó la Medalla de Oro en el Campeonato de Europa U20 y promedió 8 puntos, 3.4 rebotes, 2.9 asistencias y +10.6 valoración en 20 minutos por partido.

En la temporada 2018/19, Aina Ayuso firmó con Sant Adrià y promedió 7.1 puntos, 2.2 rebotes y 1.9 asistencias en 19 minutos por partido en Liga Femenina para posteriormente, disputar los playoffs de ascenso con Barça CBS y promediar 9.7 puntos y 4 rebotes en 22 minutos por partido.

En el verano de 2019, Aina Ayuso disputó el Europeo U20 y promedió 6.9 puntos, 3 rebotes, 5.3 asistencias y +10.3 valoración, siendo la mejora pasadora de todo el Campeonato.

En la temporada 2019/20, Aina Ayuso firmó con Mann Filter Zaragoza y promedió 5.9 puntos, 4 rebotes, 3.2 asistencias y + 7.5 valoración en 27 minutos por partido.

Llegada la temporada 2020/21, Aina Ayuso continuó en Zaragoza y promedió 3.9 puntos y 2.7 rebotes en 19 minuts por partido con Baloncesto Zaragoza, siendo también convocada por Lucas Mondelo para la Selección Española Absoluta.

En Abril de 2021, Aina Ayuso fue la número 34 del WNBA Draft, seleccionada por Los Angeles Sparks.

Aina Ayuso firmó con Campus Promete en la temporada 2021/22 y fue una de las mejores bases de la Liga Femenina promediando 8.3 puntos, 4 rebotes y 4 asistencias por partido.

Llegada la temporada 2022/23, Aina Ayuso firmó en Grecia con Olympiacos y promedió 8.4 puntos, 3.8 rebotes y 4.8 asistencias por partido en la Euroliga y 9.2 puntos, 3.9 rebotes, 5.4 asistencias y +14.8 valoración por partido en Liga Griega, proclamándose campeona de la competición.

Aina Ayuso regresó a España en la temporada 2023/24 y firmó con Hozono Jairis promediando 8.5 puntos,3.9 rebotes, 3.9 asistencias, 3.4 faltas recibidas y +10.2 valoración por partido.

En la temporada 2024/25, Aina Ayuso renovó con Jairis y promedió 9.7 puntos, 5.4 rebotes, 4.5 asistencias y +14.1 valoración en 26 minutos por partido en Liga Femenina y 7.5 puntos, 3.6 rebotes, 5.9 asistencias por partido en la Eurocup además de convertirse en una jugadora habitual en la Selección Española.

En Marzo de 2025, Aina Ayuso ganó la Copa de la Reina y fue nombrada MVP tras derrotar consecutivamente a Valencia, Girona y Salamanca y promediar 13.3 puntos, 10 rebotes, 5.3 asistencias y +21.7 valoración.